Biopuces

Les séances du groupe de travail biopuces ont lieu généralement le jeudi à 9h30 en salle RDC de l’accueil du centre INRA, Auzeville. Le groupe de travail est animé par Laurence Liaubet (GenPhySE) et Nathalie Villa-Vialaneix (MIAT) après avoir été créé et animé à la perfection, pendant de longues années, par Magali San Cristobal.

Pour s’inscrire / se désinscrire de la liste de diffusion, il suffit d’envoyer un email à nathalie.vialaneix[AT]inrae.fr.

À venir

2019/2020

  • 26 septembre 2019 : Fanny Mathevet Intégration de données omiques pour l’étude de l’impact des contaminants alimentaires sur le métabolisme et le développement de cancers

  • 10 octobre 2019 : Alain Paris Analyse métabolomique d’anomalies endocriniennes chez des sportifs. Modélisation longitudinale des trajectoires métaboliques

  • 14 novembre 2019 : Tom Rohmer Présentation de projets de recherche et questions ouvertes autour de données de DAC et de l’analyse de phénotype haut-débit. Digression sur l’outil statistique copules

  • 12 décembre 2019 : Bertrand Servin (potentiellement secondé de Nathalie Vialaneix) Journal club sur la relation entre effets génétiques dans les réseaux de co-expression de gènes et variabilité phénotypique. article 1 et article 2 - présentation Nathalie and présentation Bertrand

  • 9 janvier 2020 : Léa Boyrie Towards a network approach to detect genome-wide signature of gene coadaptation using SNP data

  • 6 février 2020 : Sandrine Laguerre Simulations de données pour calculer le temps de demi-vie des ARNm

  • 26 février 2020 : Pierrelee Michael TimeNexus identifies dynamic pathways from gene expression time-series using temporal networks

  • 26 mars 2020 : séance annulée

  • 26 avril 2020 : séance annulée

  • 4 juin 2020 : séance annulée

2018/2019

  • 13 septembre 2018 : Martin Beaumont Stratégies de mise en évidence de métabolites associés à un phénotype d’intérêt à partir de spectres RMN

  • 8 novembre 2018 : Carine Genet Intégration de données phénomiques et transcriptomiques ovines avec mixOmics

  • 29 novembre 2018 : Gaëlle Lefort ASICS: un package R pour l’identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

  • 20 décembre 2018 : Cécile Apert IL-2 and IL-15 shape Treg development in the thymus

  • 17 janvier 2019 : Nathalie Vialaneix Une courte introduction à l’analyse statistique de données single-cell

  • 14 février 2019 : Matthias Zytnicki Expression différentielle des petits ARNs à partir de données RNAseq

  • 21 mars 2019 : Allan Bertide Prédiction d’un caractère binaire (malade/non malade) à partir de données de métagénomique 16S

  • 11 avril 2019 : Laurent Cauquil Une présentation du package R Metacoder pour l’analyse de phylogénies

  • 16 mai 2019 : Raphaël Mourad Computational identification of 3D genome determinants using regression models

  • 20 juin 2019 : Cyril Kurylo Détection de compartiments génomiques à partir de données Hi-C et Camille Guilmineau Analyse des données metabolomiques du projet SubPig

2017/2018

  • 28 septembre 2017 : Sylvain Foissac Annotation fonctionnelle des génomes d’animaux d’élevage : intégration de données dans le cadre du projet Fr-Agencode

  • 19 octobre 2017 : Maria Marti-Marimon Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

  • 7 décembre 2017 : Matthias Zytnicki Méthodes de quantifications de (s)RNA-Seq prenant en compte les lectures s’alignant sur plusieurs loci

  • 14 décembre 2017 : Elias Salem (et Gilles Meyer) Étude du pathobiome respiratoire chez les jeunes bovins atteints de bronchopneumonie infectieuse

  • exceptionnellement un lundi à 14h 22 février 2018 : Leila Khajavi Transcriptional regulation of narcolepsy

  • 01 février 2018 : Guillaume Devailly Marques épigénétiques et diversité des transcrits chez l’humain

  • 15 mars 2018 exceptionnellement à 14h : Laurent Cauquil & Sylvie Combes Normalisation des données de composition de communauté microbienne à partir de table d’abondance taxonomique issu de séquençage d’amplicons ADNr16S

  • 12 avril 2018 : Pierre-Damien Denechaud Unraveling the circadian kinome in liver physiology and diseases

  • 17 mai 2018 : Annie Robic ARN circulaires (caractérisation dans le testicule porcin) et recherche de liens avec la quantité d’androsténone accumulée dans le gras (analyses de corrélation multiples)

  • 14 juin 2018 : Camille Mestre Identification de relations enhancer/gène dans les génomes animaux

2016/2017